Generalna konferenca je jeseni 2007 določila srednjeročno strateško strategijo za obdobje 2008–2013, ki je sestavljena iz petih dopolnjujočih se ciljev po posameznih področjih. V okviru vsakega cilja bodo določeni 2–3 strateški programski cilji oziroma usmeritve.

Okvir celotne strategije postavljata dve medsektorski prednostni nalogi: Afrika in enake možnosti. Strategija je z Unescovim mandatom namenjena podpori državam v postkonfliktnih razmerah in po naravnih nesrečah.
Cilji Slovenske nacionalne komisije za Unesco za srednjeročno obdobje 2008–2013 so:
• izvajanje obveznosti iz članstva Republike Slovenije v Unescu;
• izvajanje Unescovega programa;
• doseganje učinkovitosti in prepoznavnosti Unesca v Sloveniji;
• sodelovanje v dejavnostih Unesca, ALECSO (Organizacija Arabske lige za izobraževanje, kulturo in znanost) in Sveta Evrope na področju medkulturnega in medverskega dialoga. Medkulturni dialog bo ena od tém v času slovenskega predsedovanja Svetu EU. Unesco je v sistemu OZN nosilna organizacija za področje medkulturnega in medverskega dialoga;
• sodelovanje v posebnih Unescovih programih – IHP, IGCP, IOC, MAB, ASP MOST, IFAP;
• okrepitev sodelovanja z drugimi nacionalnimi komisijami, z Unescovim sedežem in njegovimi regionalnimi uradi.